一、行政机构

县环境保护局 1985年，安溪县环境保护办公室成立，为安溪县建委内设机构，没有独立编制。1990年4月，撤销安溪县环境保护办公室，安溪县人民政府环境保护局成立（简称县环保局），科级建制，行政编制5人。1996年7月，县环保局内设秘书股、管理监督股、法规宣教股，行政编制8人，工勤1人。2002年7月，更名为安溪县环境保护局，秘书股改为人秘股，行政编制6人，工勤1人。2007年，增设行政审批股，编制没变。

二、事业机构

县环境监察大队 1990年10月，安溪县建委下属安溪县排污收费监理所划归环保局管理，编制4人。1996年，县排污收费监理所更名为县环境监理所，编制7人。2004年4月，县环境监理所更名为县环境监察大队。2007年，机构、编制没变。

县环境监测站 1991年7月，安溪县环境监测站成立，隶属县环保局，编制3人。1996年，编制7人。2001年12月，县环境监测站通过省环保局、省技术监督局的计量认证，具有资质开展环境监测工作。2002年，编制10人。2007年6月，县环境监测站通过国家标准化三级站达标验收，编制10人。