（一）内河航道
1990－2005年，全省内河航道建设项目有5个，其中，闽江流域3个，晋江、汀江流域各1个，总建设里程455.2公里，总投资27767.5万元。这5个工程建成后，增加通航里程221.2公里，改善通航里程234公里，闽江流域2x500吨级顶推船队可以从福州直达南平，2X300吨级顶推船队可以直达三明市区。
1.闽江航道
1990－2005年，闽江流域实施了以下三大航运工程。
其一，高砂电站坝下至福州航运工程。该工程上起三明市沙县高砂镇高砂电站坝下，经沙溪口水电站、南平市、水口水电站、闽清和闽侯，下至福州市区解放大桥，全长221公里。建设规模为：高砂电站坝下至南平延福门长57公里，按内河V级航道设计，通航2x300吨级顶推船队；南平延福门至解放大桥164公里，按内河IV级航道设计，通航2X500吨级顶推船队。该项工程于1992年11月开工，2004年8月竣工，总投资12599.8万元。主要建设内容如下：
高砂电站坝下至沙溪口段。航道炸礁工程量12155方，各类航标32座，官蟹航运枢纽1座，上院码头1座。
沙溪口电站坝下至水口段。航道炸礁工程量4.21万立方米，航道疏泼工程量2.12万立方米，各类航标89座（对），西芹码头、马祖庙码头、延福门客运站各1座。
水口至福州解放大桥段。整治工程：抛筑丁坝7道，总长度2277.4米，总抛沙枕3.29万立方米，块石5_43万立方米。疏浚工程：挖槽总长9606米，总疏浚工程量21.15万立方米。抛设各类航标64座。增设下店工作船码头、工程船舶及航标站房等附属设施。
该工程完工后，航道浅滩水深大幅度增加，竹岐至侯官航段2米深槽全线贯通，主槽水深在3米以上；局部河段紊乱的流态消失，呈平顺态，形成微弯的良好河势，滩槽格局和水深趋于稳定。沙溪高砂电站坝下至南平延福门河段具备满足通航2x300吨级顶推船队的条件，南平延福门至福州解放大桥河段具备满足通航2x500吨级顶推船队的条件。
其二，沙溪河高砂坝上至三明航道工程。位于三明辖区，是交通部“九五”计划项目。工程按V级航道标准建设，通航2x300吨级船队，航段里程为46.9公里。1990年10月开工建设，2005年主体工程完工，总投资11200万元。工程建设主要有沙县城关船闸、斑竹船闸、三明梅列300吨级码头、航道整治与航标等工程项目。航道炸礁总工程量2.93万立方米，航道疏浚总工程量1万立方米。
其三，富屯溪航道整治工程。位于南平市顺昌县境内，航段里程60公里，航道整治规模按航行30吨级机动船设计。1990年11月开工，1993年12月完工，总投资1000万元。主要建设内容包括航道整治和码头工程。航道整治分两期进行，第一期整治7个滩段，第二期整治11个滩段及零星炸礁。
2.晋江航道
1990－2005年，晋江航道建设主要为晋江顺济桥至前埔河段航道整治工程。该工程地点位于泉州市辖区，自晋江顺济桥至前埔河段，长13公里。设计航道宽66米，深3米，航道曲率半径357.6～596米，乘潮通航500吨级船舶，通航保证率为90％。工程于1994年7月开工，2001年7月完工，总投资800万元。主要建设内容有抛坝、疏浚和航标三个项目。抛坝工程：共抛设9条丁坝，总工程量4.94万立方米。疏浚工程：共完成疏浚工程量10.1万立方米。航标工程：抛设9个灯浮，新建灯桩1座，琐头标5座。
工程竣工后，全航段水深维持在2米以上，远大于设计水深0.6米。整治后，该航道可通航500～1000吨级的船舶，使内港码头的吞吐量达到了70万～90万吨，为整治前的6倍以上。
3.汀江航道建设
1990－2005年，汀江航道建设主要为汀江航道航标工程。该工程建设地点位于龙岩市辖区汀江干流，自长汀水口至棉花滩电站坝址，航段长约141公里，大部分处于天然状态。为保证棉花滩库区水域航行安全，规范库区航道，发展库区旅游和水运事业，龙岩市交通局分别委托上杭县和永定县交通局组织辖区内航标工程的实施。工程于2002年5月开工，10月底完工，总投资356.5万元。建设内容为航标工程，共设置各种航标97座。
（二）沿海（港湾）航道
1990－2005年，全省沿海（港湾）航道主要建设项目10个，总建设里程388.1公里，总投资54607.29万元。所有工程建成后，厦门湾、湄洲湾均建成10万吨级航道，其他各港湾航道通航船舶吨级及船舶航行条件也得到较大提高和改善。
1.福州港
通海航道二期整治工程。福建省“八五”期间重点工程，建设规模按一个潮周期乘潮通航2万吨级船舶设计。上起福州电厂筹东煤码头，下至七星礁口外海滨，全长约50公里，包括大屿、新丰、中沙、马组印、内沙和外沙6处碍航浅滩。1991年1月开工，1998年4月竣工，总投资8984万元。建设内容有整治工程、疏浚工程、清障工程和航标工程。整治工程：抛筑水工建筑物有10道丁坝、3道顺坝、潜坝及护岸工程，合计总长度为9001米，抛石总工程量90.07万立方米。疏浚工程：挖槽总长度为14.09公里，疏浚总工程量27462万立方米。清障工程：中沙清障2.3万立方米，马祖印清障1.5万立方米。航标工程：建牛礁灯桩1座，新抛灯浮15座，移位灯浮6座。该工程竣工后，整治达到预期效果。大屿、新丰两个浅滩经过治理，水深大幅度提高。中沙、马祖印和内沙3个浅滩经过整治和疏浚相结合的治理，水深也有显著提高，每年只需一般维护便可维持设计水深。外沙浅滩因势利导开通南航槽，疏浚后航槽稳定，回淤不大。经过二期整治工程，福州港提升了接纳大型船舶的能力，具备乘潮通航2万吨级海轮条件。
闽江口航道增深工程。福州港闽江通海航道自七星礁至华能福州电厂煤码头全长50公里，原有大屿、新丰、中沙、马祖印、内沙和外沙6处碍航浅滩，经过二期整治后，大屿、新丰浅滩已不复存在，浅滩航槽水深从原来的-3米至-4米増至-5.8米至-6.3米，闽江口通航能力从乘潮通航5000吨级海轮提高至乘潮通航2万吨级海轮。工程范围：从粗芦岛玉霞灯桩至闽江口外，全长20公里，设计航道底宽150米，航道底标高中内沙航段-7.6米，外沙航段-8.0米。工程于2005年10月开工，计划投资8900万元。建设内容为：抛筑丁坝17.38万立方米，疏浚工程量为484.2万立方米，移位航标6座。
江阴港区5万吨级进港航道工程。位于福州市辖区江阴港区，建设规模为全天候通航5万吨级集装箱轮航道。航道长44公里，设计尺度为双向航道底宽360米，按设计水深全天候通航。工程于2002年9月开工，11月竣工，建设投资1003.85万元。主要建设内容为疏浚挖槽总长2公里，工程量30万立方米，抛设水上灯浮12具，建设灯桩1座，以及相应锚地3处。工程竣工后，5万吨级集装箱轮可直达江阴港区。
福清湾三万吨级航道工程。福建省合资建设项目，为元洪3万吨级码头的配套工程。工程于1993年5月开工，次年8月竣工，总投资920.63万元。主要建设内容包括疏浚工程、炸礁工程和航标工程。疏浚工程总工程量95508立方米。炸礁工程总工程量4872立方米。航标工程：抛设浮标2具，建设活节式灯桩4座、立屿灯桩座1座，吉钓、苦屿各设导标1对。工程竣工后，3万吨级船舶可以乘潮通过该航道，直抵元洪投资区码头。
福州可门火电厂一期5万吨级进港航道工程。中国华电集团福州可门火电厂一期每年约需进口300.3万吨煤炭，二期每年需进口1201.2万吨煤炭，需相应配套建设5万吨级航道。该工程位于福州市辖区罗源湾，建设规模为乘潮通航5万吨级船舶的单向航道，长14.7公里，航道设计底宽180米，设计底标高-10.0米，转弯半径1383～2765米，乘潮水位4.79米，乘潮历时4小时，乘潮保证率95％，设计代表船型为225米X32.3米xl3米（长x宽x满载吃水）的5万吨级散货船。工程于2005年7月开工，年底完工，总投资390万元。工程主要建设内容为新建灯桩2座，重建旧灯桩3座，开辟口门外北侧水域规划锚地为引水、候潮、检疫锚地，口门内岗屿附近设置避风锚地。
2.厦门港（厦门湾）
10万吨级航道一期工程。位于厦门湾，建设规模为厦门港内外主航道（A-E），设计底标高-12.0米，航道底宽250米。海沧支航道设计底标高-11.5米，航道底宽180米。博坦航道设计底标高-11.5米，航道底宽250米，可满足10万吨级油轮乘潮通航要求，以及第三代集装箱基本全天候通航要求。工程于1998年7月开工，次年9月完工，总投资1.05亿元。主要建设内容为疏浚总长度7.8公里，总疏浚工程量480万立方米，抛设灯浮13座，系船浮筒6只，建设导标1对，调整原有灯浮5个，拆迁海底电缆2条，测量面积4038平方公里，扫海38平方公里。
10万吨级航道二期工程。该工程自东碇岛外侧20米等深线起，经青屿水道及厦鼓南航道再到海沧港区，全长43公里，其中主航道长38.8公里。建设规模满足厦门港货物吞吐量增长和集装箱船舶大型化的需要，适应全天候通航第五、第六代集装箱，兼顾13.5万立方米LNG液化船全天候及10万吨级、15万吨级油轮的乘潮通航要求。设计航道底标高-14.0～14.5米，设计底宽300米。海沧支航道长4.8公里，设计底宽250米。工程于2003年5月开工，次年6月完工，工程总投资1.59亿元。主要建设内容为疏浚工程量1007万立方米，炸礁工程量1500方，抛设HF3.0灯浮2座，调整灯浮9座，并在青屿增设雷达应答器，扫海14平方公里。
东渡港区猴屿西航道工程。位于厦门湾，建设规模为航道设计底标高-10.5米，航道底宽200米，可满足5万吨级船舶乘潮通航和2.5万吨级船舶双向通航要求。工程2001年开工，次年完工，总投资7491.50万元。主要建设内容为疏浚工程量84.36万立方米，炸礁工程量13.77万立方米，抛设HF2.4灯浮4座，建设灯桩1座，迁移系船浮筒3座。
厦鼓航道工程。航道设计底标高-7.5米，航道底宽150米，可满足全天候中型近洋游轮单向通航要求。工程于2001年开工，次年完工，总投资414万元。主要建设内容为炸礁工程量8987方，抛设HF2.4灯浮3座，拆除航标5座，调整3座。
海沧港10号泊位进港航道工程。航道设计底标高-7.5米，航道底宽160米，可满足2万吨级船舶单向乘潮通航和2万吨级液体化工船舶乘潮通航要求。工程于2001年开工，次年完工，总投资1075万元。主要内容为疏浚工程量41.25万立方米，抛设HF2.4灯浮2座。
厦门至金门间厦金航道工程（厦门段）。分为两条航线，航线一：航道设计底标高-6.4米，航道底宽150米，满足客轮及3000吨级杂货船双向通航需要，兼顾5000吨级货船乘潮通航需要，乘潮水位2.1米。航线二：满足大轮航线及通航万吨级船舶要求。工程于2005年开工，同年完工，总投资403万元。主要内容为抛设HF2.4灯浮9座。
漳州后石电厂10万吨级航道工程。位于金门湾、厦门港界外侧水域，是全省最大的台商独资企业和重要的基础设施项目。该电厂航道自东碇岛外20米等深线起，经厦门10万吨级的外航道AB段，至后石电厂煤码头，全长21.4公里。为10万吨级船舶乘潮单向航道，乘潮保证率90％，设计代表船型为260米x39米x15.2米（船长x船宽x满载吃水）。设计航道底宽250米。乘潮水位：AB段4.25米，BHI段4.54米。航道底标高：AB段-13.94米，BHI段-13.65米。工程于1999年3月开工，同年9月完工，2002年8月通过竣工验收，总投资2033.27万元。主要建设内容有疏浚、炸礁、航标及扫海工程。疏浚工程总工程量17.26万立方米，炸礁工程总工程量1.6万立方米，航标工程建设导标一对，抛设灯浮10座，扫海面积为23.5平方公里。
3.泉州港（不含湄洲湾>
后渚港区通海航道一期整治工程。上起石油码头，下至湾口引航锚地，全长16.9公里，设计航道底宽80米，航道底标高-4.0米。工程于1996年10月开工，1998年11月完工，总投资2253.83万元。主要建设内容为抛坝、疏浚及航标工程。抛坝工程：抛设5条丁坝，总长度3321米，总工程量10.18万立方米。疏浚工程：疏浚区总长2500米，总疏浚工程量59.3万立方米。航标工程：抛设灯浮5座，更新4座，改建导标1对。工程竣工后，航道平均水深从整治前的3.3米提高至4.5米，航槽流速也有所提高。港池在三道丁坝的作用下，3000吨码头港池及上游航道的流速有一定提高，平均水深从整治前的2.7米提高至4.1米。
泉州湾3万吨级通海航道工程。自湾口外引航、联检锚地起，经大、小坠门至石湖港区止，长约12公里，湾内有石湖和后渚等主要港口作业区。后渚码头可靠泊5000吨级海轮，石湖码头可靠泊1万吨级海轮。随着石湖3万吨级码头的建设和进出港湾船舶航行密度的增加，该段航道因水深不足和航道较窄已不能满足船舶航行需要。工程设计标准为航宽160米。设计底标高：炸礁区-11.0米，疏浚区-9.5米。2002年4月开工，次年8月完工，总投资3000万元。主要建设内容和工程量：疏浚120.6万立方米，炸礁4.98万立方米，新设航标1座，移位5座。
4.莆田港（湄洲湾）
湄洲湾10万吨级航道工程。湄洲湾航道原可通行3万吨级以下海轮，在福建炼油厂于该地兴建1座10万吨级专用码头后，开辟与之相匹配的10万吨级航道成为当务之急。工程建设地点自湾口剑屿起至湾顶秀屿镇止，全长29.5公里。福建炼油厂支航道自炼油厂10万吨级油码头起至主航道的连点止，长4.8公里。1991年9月开工，1997年6月完工，总投资2071万元。主要建设内容为疏浚、航标、锚地及航标基地设施。疏浚工程：总疏浚工程量54.2万立方米。航标工程：共抛设弹性灯桩8座、灯浮7座，建设灯桩2座、导标3对。锚地工程：设定成品油轮锚地、候潮锚地和引水锚地各1个。航标维护基地：100吨级航标船舶专用码头1座、宿舍楼1座、办公综合楼1座、维修车间1座及基地堆场。工程竣工后，10万吨级油轮可以不分昼夜乘潮进入炼油厂码头。
湄洲湾火电厂专用支航道工程。自湄洲湾10万吨级主航道7号灯浮起至湄洲湾火电厂重件码头止，全长4.33公里。建设规模为全天候通航1600马力拖轮旁推2000吨级驳船队，设计代表船型为73.3米X26.4米x3.0米（船长x船宽x满载吃水）。设计航道底宽120米，航道底标高-4.6米（理论基准面）。1999年5月开工，1999年12月完工，2000年3月通过竣工验收，总投资1303万元。主要建设内容为疏浚、炸礁、航标及过驳锚地工程。疏浚工程：总疏浚工程量18.8万立方米；炸礁工程：总炸礁工程量0.97万立方米；航标工程：抛设钢筋砼结构灯桩2座，抛设直径2.4米灯浮1座、直径1.8米灯浮3座；锚地工程：设定过驳锚地1个，位于湄洲湾10万吨级主航道7号灯浮东侧，采用单浮筒系驳方式，系船浮筒选用XF5.5-D1标准型，配置直径107铸钢有挡链，选用42吨钢筋砼沉锤。5.宁德港
三都澳白马港区进港航道工程。从吉壁角引水锚地至白马港区，42.2公里。其中，吉壁角锚地至青山北礁附近（E点）长20公里，为双向航道，全天候通航万吨级船舶；E点至白马港区22.22公里，为单向航道，乘潮通航万吨级船舶（乘潮保证率90％）；吉壁角锚地经白岛屿灯桩附近（C点）至城澳港万吨级多用途码头，长18.2公里，为双向航道，全天候通航万吨级船舶。工程于1999年5月开工，同年9月竣工，总投资180万元。建设内容为航标和锚地工程，共抛设灯浮12具，布设控制水位标尺1座，禁锚标志2对，联检锚地、待泊锚地各1个及相应助航设施。
大唐宁德电厂码头5万吨级进港航道工程。工程建设规模为：乘潮通航5万吨级船舶单向航道，长31公里，航道底宽180米，设计底标高-10.5米，转弯半径为1125～2500米，乘潮水位5.2米，乘潮保证率为95％。设计代表船型为225米x32.3米x13米（船长x船宽x满载吃水）。2005年4月开工，次年完工，计划总投资1955.44万元。主要建设内容和工程量：疏浚66.43万立方米，新建灯桩2座，新抛设灯浮2具，移位灯浮1具，新设长腰岛待泊候潮锚地，扩大原吉壁角描地。
（三）助航标志
1.内河助航标志
闽江干流配布类别按内河I类航标配布。依托富屯溪航道整治工程，设置各类航标85座，建造1座五层航标站房，建筑面积852.76平方米，购置48匹航标艇1艘，工程于1993年3月开工，同年10月完工，投资387万元。沙溪口电站坝下至水口段设置各类航标89座（对），其中，沿岸标39座，过河标24座，侧面标16座，鸣笛标2座，左右通航标1座，桥涵标7对，工程于1993年12月开工，1996年1月完工，投资268.7万元。依托高砂电站坝下至福州航运工程，高砂电站坝下至沙溪口段设置各类航标32对，其中，沿岸标7座，过河标9座，桥涵标1对，浮标14座，工程于1998年5月开工，次年12月完工，投资62.2万元。
晋江依托顺济桥至前埔河段航道整治工程，抛设9个灯浮，新建灯桩1座、坝头标5座，工程于2000年10月开工，次年4月完工，投资20万元。水口至福州解放大桥段设置各类航标64座，其中，沿岸标11座，过河标23座，侧面标浮标27座，桥涵标2对，指路牌1座，投资115.7万元。同时建设航标站房、航标艇等附属设施，工程于2002年9月开工，次年1月完工，投资569.6万元。依托沙溪河高砂坝上至三明航道工程，设置沿岸标16座，过河标13座，浮标7座，桥涵标13对，侧面标1座，指示牌1座，工程于2003年10月开工，次年3月完工，投资110万元。
汀江设置沿岸标、过河标、浮标、桥涵标、禁航水标和指路标等航标97座，2002年5月开工。棉花滩电站至上杭城关水南大桥63.0公里航道，其中，永定县境内21.5公里，设置1～24号标；上杭县境内41.5公里，设置25～55号标。黄潭河支流河口至稔田镇27公里河段，其中，永定县境内12公里，设置黄1号至黄11号标，上杭县境内15.5公里，设置黄12号至黄23号标。罗家营支流11公里，设置黄1号至黄8号标。中村支流4公里，设置黄1号至黄3号标。桃泉支流8公里，设置黄1号至黄7号标。横桥支流2公里，设置横1号标。工程于2002年5月开工，10月完工，投资356.5万元。
2.通海及港湾助航标志
福州港依托福清湾3万吨级航道工程，设置浮标2具、活节式灯桩4座、立屿灯座1座，吉钓与苦屿各设导标1对，工程于1993年5月开工，次年8月完工，投资221.5万元。依托福州港通海航道二期整治工程，设置牛礁灯桩1座，新抛灯浮15具，移位灯浮6具，工程于1995年8月开工，10月完工，投资221万元。依托福州港江阴港区5万吨级进港航道工程，设置灯浮12具，灯桩1座，工程于2002年9月开工，11月完工，投资198.8万元。依托福州可门火电厂一期5万吨级进港航道工程，新建灯桩2座，重建旧灯桩3座，工程于2005年7月开工，12月完工，投资390万元。依托福州港闽江口航道增深工程，移位航标6具，工程于2005年10月开工，12月完工，投资25.5万元。
厦门港（厦门湾）依托厦门10万吨级航道一期工程，抛设灯浮13具，设置系船浮筒6只，建设导标1对，调整原有灯浮5具，工程于1999年1月开工，9月完工，投资650万元。依托漳州后石电厂10万吨级航道工程，建设导标1对，抛设灯浮10具，工程于1999年3月开工，9月完工，投资421万元。
依托厦门港东渡港区猴屿西航道工程，抛设灯浮4具，建设灯桩1座，迁移系船浮筒3座，工程于2001年开工，次年完工，投资135.万元。依托厦门港厦鼓航道工程，抛设灯浮3具，拆除航标5座，调整3座，工程于2001年开工，次年完工，投资83万元。依托厦门海沧港1〇号泊位进港航道工程，抛设灯浮2座，工程于2001年开工，次年完工，投资20万元。
依托厦门10万吨级航道二期工程，抛设灯浮2具，调整9具，并在青屿增设雷达应答器，工程于2003年5月开工，次年6月完工，投资120万元。依托厦门至金门间厦金航道工程，抛设灯浮9具，工程于2005年开工，年底完工，投资403万元。依托厦门港东部港区5000吨进港航道工程，抛设灯浮19具，工程于2005年开工，同年完工，投资238万元。
泉州港（不含湄洲湾）。依托泉州后渚港区及通海航道一期整治工程，抛设灯浮5具，更新4具，改建导标1对，工程于1996年10月开工，1998年11月完工，投资76.71万元。依托泉州3万吨级通海航道工程，设置航标1座，移位5座，工程于2002年4月开工，次年8月完工，投资32万元。
莆田港（湄洲湾）。依托湄洲湾10万吨级航道工程，抛设8座弹性灯桩、7具灯浮，建造2座灯桩、3对导标，并配有雷达应答器、雷达反射器和雷达指向标等航标器材。建设航标维护基地，包括1〇〇吨级航标船专用码头1座、宿舍楼1座、办公综合楼1座、维修车间1座及基地堆场，工程于1991年9月开工，1997年6月完工，投资896万元。
宁德港。依托三都澳白马港区进港航道工程，抛设灯浮12具，布设控制水位标尺1座、禁锚标志2对，工程于1999年5月开工，同年9月完工，工程总投资180万元。依托大唐宁德电厂码头5万吨级进港航道工程，新建灯桩2座，新抛设灯浮2具，移位灯浮1具，工程于2005年4月开工，同年12月完工，投资1955.44万元。