县政协的工作机构，包括办公室、各专门委员会和工作委员会及专门委员会办公室。
各专门委员会、工作委员会（乡镇工作组）
政协各专门委员会和工作委员会（乡镇工作组），是在县政协常委会和主席会议领导下，组织委员开展经常性活动的工作机构，是履行人民政协“政治协商、民主监督、参政议政”职能的具体组织形式，是全体委员为三个文明建设献计献策的重要场所。根据形势的发展和行政区划的变动，历届委、组的设置和名称都有所不同。
1984年7月县政协第一届委员会设置学习宣传、文史资料、工业科技、农业科技、教育、工商、医药卫生、民族和台侨宗教等9个工作组。
1985年3月一届2次会议将提案审查委员会、学习宣传工作组、文史资料工作组，改设为提案工作委员会、学习委员会、文史资料研究委员会，工业科技、农业科技、教育、工商、医药卫生、民族和台侨宗教工作组不变，并增设工青妇和民族2个工作组，共设3个委员会、9个工作组。
1986年3月一届3次会议增设建立壶山、柳城、桃溪、下杨、新宅、桐琴等6个区（镇）委员联络小组。办事机构增加到3委、9个工作组和6个区镇委员联络小组。
1987年4月第二届委员会设置学习、文史资料研究、提案工作3个专门委员会，同时设工青妇、工业科技、农业科技、教育、工商、医药卫生、文化、法制、祖国统一、民族宗教10个工作组及柳城区、桃溪区、下杨区、城关区、新宅区、桐琴区、壶山镇等7个区镇联络组。
1990年4月第三届委员会设置提案、学习、文史资料、经济科技、文教卫体、社会法制、祖国统一等7个专门委员会和7个区（镇）联络组。
1992年7月，根据撤区、扩镇、并乡后的实际情况，为便于农村政协委员开展活动，政协武义县第三届委员会常务委员会第15次会议决定，建立柳城、桃溪、白姆、履坦、武阳、泉溪、桐琴、大田等8个联络组。
1993年4月第四届委员会将文教卫体委员会划分为教育文化体育、医药卫生两个委员会，增设农村工作、民族宗教2个委员会，乡镇联络组改为武阳片、王宅片、桃溪片、柳城片、桐琴片、新宅片、东莹工作组。
1996年7月9日，武政协〔1996〕10号文件将工作机构从“一办十委”调整为“一办六委”，即：办公室和提案、文史与学习、经济科技、教文卫体、社会法制、台港侨联谊等6个委员会。
第五届委员会与第四届委员会工作机构设置相同。仅增加履坦镇工作组。
1998年9月10日，县政协第五届委员会常务委员会第3次会议，将“经济科技委员会”更名为“经济委员会”；“教文卫体委员会”更名为“科教文卫体委员会”；“台港澳联谊委员会”调整更名为“三胞联谊委员会”。2001年2月23日，武政协〔2001〕5号文件，将“文史与学习委员会”更名为“文史资料委员会”。机构设置仍为“一办六委八组”。
第六届委员会设提案、经济、科教文卫体、社会法制、文史资料、港澳台侨6个专门委员会。根据机构改革后的具体情况，改工作组为工作委员会，设白洋、壶山、熟溪、柳城、履坦、桐琴、泉溪、新宅、王宅、桃溪、茭道等11个工作委员会。2003年5月26日，县政协在武阳楼召开专工委主任会议，举行了政协工作委员会授牌仪式和各专工委正副主任颁发任命书仪式。
县政协机关
县政协机关设办公室和专门委员会办公室两个具体办事机构，正科级。
1984年7月，办公室下设行政秘书科和联络科。2003年4月，行政秘书科调整为行政科和秘书科。县政协办公室的主要职责是：组织实施县政协全体会议、常委会议、主席会议的决议、决定；组织县政协全体会议、常委会议、主席会议及其他重要会议的会务工作；组织县政协常委会工作报告、县政协领导人讲话及其他重要材料起草工作；组织安排在武义县的省、市政协委员的视察、调查、座谈、研讨等活动；联系县委、县人大、县政府有关部门；宣传政协理论和政协工作，收集、整理、反映社情民意及其他重要信息；负责县政协机关的人事、行政后勤、综合治理、财务工作及离退休人员管理服务工作。设办公室主任、副主任各1名。
2002年12月，增设专门委员会办公室。联络科从政协办公室划入专委会办公室。县政协专门委员会办公室的主要职责：联系县政协各专门委员会、工作委员会日常工作和活动开展情况，按照县政协常委会议、主席会议要求督促各专工委做好工作；围绕县政协各专门委员会、工作委员会履行职能开展的各项专题活动，做好服务工作；负责各专门委员会、工作委员会开展专题调研、提案建议、经验交流等方面有关文件、材料的组织、整理、核稿工作；负责武义文史资料的征集、整理、编排、出版、校对、发行工作。专委会办公室设主任1名。
政协中共组织
政协武义县第一届委员会于1984年11月1日建立中共武义县政协党组，历任党组书记、副书记名单如下：
党组书记：
王祖旺（1984-11～1993-09）
张育林（1993-09～2002-01）
钟明祥（2002-01～）
副书记：
陈正财（1987-05～1993-04）
张育林（1993-03～1993-09）
陈珠生（2002-12～）
政协武义县委员会下属单位
武义县政协之友联谊会是政协武义县委员会领导下的联谊团体，成立于1993年8月。联谊会的宗旨是：保持和加强与非应届的历届县、市、省政协委员以及热心政协事业的社会人士的联系，联络感情，增进友谊，坚持党的基本路线，为稳定社会、统一祖国、发展经济、振兴中华、推进武义县社会主义现代化建设作贡献。联谊会下设政协联谊贸易公司，后在清理、整顿机关部门所办企业时脱钩。
浙江武义联谊高级中学是政协武义县委员会的又一下属单位。该校原名政协武义县文化补习学校，创办于1984年9月。办学宗旨：拾遗补缺、培育人才。师资来源：聘请离退休教师任课为主，部分在职教师兼课相配套。后改名为政协文化科技学校。1994年5月，在原文化科技学校的基础上，创办浙江武义联谊高级中学，由武义县政协之友联谊会主办。政协曾设有律师顾问处。