一般每年举行一次。从1988年3月召开六届二次会议起，至2010年共举行24次全体会议。每届首次大会协商产生大会主席团，并由主席团主持会议，举行换届选举，选举主席、副主席、秘书长和常务委员，组成常务委员会。每届第一次全会后，由常委会主持会议。
每次全会，市委书记都到会讲话。市政协主席在闭幕会上讲话（2005年开始，取消这一议程）。听取并审议政协常委会工作报告和提案工作报告。列席人代会，听取、审议政府工作报告等。部分委员就政府工作作大会发言。
第六届政协
第一次会议（1987.5.21～31）前志已记述。
第二次会议（1988.3.21～25）分别围绕发展外向型经济、农业腾飞、深化和加快企业改革、加强教文卫工作等方面的问题进行协商。增选1名常务委员。收到提案178件。
第三次会议（1989.4.3～7）就经济体制改革、社会民生事务等方面的问题进行协商。学习全国政协关于政治协商、民主监督的暂行规定。收到提案214件。
第七届政协
第一次会议（1990.5.7～13）选举市政协主席、副主席、秘书长和常务委员。就治理整顿、深化改革、两个文明建设和加强政协、统战工作等方面的问题进行协商。收到提案295件。
第二次会议（1991.3.20～24）就城市建设、农业产业化、发展外向型经济等方面的问题进行协商。收到提案224件。
第三次会议（1992.3.22～28）会议同意徐八达辞去市政协主席、蒋赣平辞去副主席职务；选举朱家龙为市政协主席。就建立河姆渡农业开发区、发展商贸服务业等方面的问题进行协商。收到提案223件。
第八届政协
第一次会议（1993.3.8～13）选举市政协主席、副主席、秘书长和常务委员。就乡镇企业改革、农业市场化、加强历史文化名城规划管理等方面的问题进行协商。收到提案200件。
第二次会议（1994.3.4～7）就深化国有企业改革、加强城市管理、促进外向型经济发展等方面的问题进行协商。收到提案160件。
第三次会议（1995.3.6～9）围绕重视非公有制经济发展、推进教育卫生体制改革、加强法制建设等方面的问题进行协商。收到提案215件。
第四次会议（1996.3.9～15）增选1名市政协副主席和1名常务委员。就改革开放、经济建设、社会发展中的重大问题和完善“九五”计划等方面的问题进行协商。收到提案204件。
第五次会议（1997.3.3～7）同意王亦娟辞去市政协副主席职务，增选1名市政协副主席和2名常务委员。就加强国有资产有效配置、加快农业产业化进程、保护水环境、加强青少年思想道德建设、发展旅游事业、健全农村医疗预防保健网、加强城市规划和管理等方面的问题进行协商。收到提案185件。
第九届政协
第一次会议（1998.2.22～26）选举市政协主席、副主席、秘书长和常务委员。就建设现代化农业示范园、发展环保产业、改善投资软环境、加强非公有制经济行业管理、深化教育改革、推进再就业工程、加强社会治安管理及反腐倡廉工作等方面的问题进行协商。收到提案180件。
第二次会议（1999.3.7～11）增选1名市政协副主席。就建立土地流转机制、加快小城镇建设、巩固扶贫成果、加强村级民主法制建设等方面的问题进行协商。收到提案197件。
第三次会议（2000.2.21～24）就发展文化旅游业、推进企业技术创新、加强农业新技术推广、发展社区卫生服务、加强职工社保等方面的问题进行协商。收到提案148件。
第四次会议（2001.2.10～14）接受蒋赣平辞去市政协副主席职务的请求，接受胡大可辞去市政协秘书长职务的请求，补选秘书长和1名常委。。就加速农业与市场对接、推进城市化进程、发展农村教育事业、构筑社会治安综合治理防范体系等方面的问题进行协商。收到提案151件。
第五次会议（2002.1.25～28）就发展外向型农业、解决中小企业融资难、推进撤村建居、打造诚信余姚等方面的问题进行协商。收到提案160件。
第十届政协
第一次会议（2003.2.22～25）选举市政协主席、副主席、秘书长和常务委员。就推进新型工业化、推进城市化建设、发展职业教育、加强城区治安防范等方面的问题进行协商。收到提案206件。
第二次会议（2004.1.30～2.2）就发展都市型农业、加快城镇化建设、解决被征地农民就业和社会保障、推进卫生体系建设、加强农村文化建设等方面的问题进行协商。收到提案144件。
第三次会议（2005.1.31～2.2）增选1名市政协副主席。就统筹城乡公共交通事业、优化农村教育、加强流动人口管理等方面的问题进行协商。收到提案189件。
第四次会议（2006.1.20～23）就促进塑料产业集群的形成、发展群众文化事业、建设宜居城市、推进四明山红色旅游开发等方面的问题进行协商。收到提案204件。
第十一届政协
第一次会议（2007.2.3～7）选举市政协主席、副主席、秘书长和常务委员。就加快科技创新体系建设、完善帮困扶贫体系、加强农民职业技能培训等方面的问题进行协商。收到提案230件。
第二次会议（2008.1.22～25）就推动科学发展、改善民生、促进和谐等方面的问题进行协商。收到提案202件。
第三次会议（2009.2.8～11）补选6名常委。就促进经济平稳较快增长、改善民生、推进农村改革发展等方面的问题进行协商。收到提案161件。
第四次会议（2009.6.26）同意孙钜昌辞去市政协主席职务，选举陈建泰为市政协主席。
第五次会议（2010.1.19～22）增选1名市政协副主席，补选2名常委。围绕工业振兴、产业提升、需求拉动、城市再造、区块联动、民生关爱等方面的问题进行协商。收到提案170件。