净慈寺，位于西湖南岸南屏山之北。首任住持延寿（９０４—９７５），俗姓王， 钱塘（今浙江杭州）人。曾任华亭镇将，因动用库钱放生而被判处死刑。行刑时泰然自若而遇赦，遂出家龙册寺。去天台山华顶天柱山禅定９０多天，连小鸟在他衣服中筑巢都没有发觉。出定之后，参拜禅宗法眼宗二祖天台德韶国师，密授玄旨，成为最上首弟子。他在调和佛教各宗派的分歧中，力主禅宗、净土宗融合一致，倡导禅净双修，对当时与后世影响很大。

后周显德元年（９５４），吴越王钱俶为永明延寿禅师建寺，号“慧日永明院”。

其后相继改名寿宁院、净慈禅寺（１１２８）。重新后，“金碧辉煌，华梵绚丽，行都道场之盛，特冠诸山”，并建有五百罗汉田字殿。南宋绍兴初为净慈报恩光孝禅寺（１１３９），后毁，孝宗赐金重建。嘉定三年（１２１０），少林妙崧奉旨主持１２ 年，再次重修，“闳胜甲于湖山”，列为禅宗五山之一，并以“南屏晚钟”称胜湖上。当时寺中心有五层主殿，两旁配有偏殿，各类阁、堂、轩、楼等共３３座，寺僧达数千人。可谓壮观之极。接着曹洞宗第十三代祖如净两度来寺主持。宝庆元年（１２２５），如净主持天童寺，日本僧人永平道元得如净授法，回国后创曹洞宗，奉如净为日本曹洞宗祖师。如净圆寂后归葬南屏，至今净慈寺墓塔仍存，日僧奉为祖塔。净慈寺以后经元、明两代，屡有毁建。清初重新，诸帝多有封赏，并赐额题诗。