伊通河 伊通河发源于伊通县板石乡青顶子岭北，经柳罐印子屯进入郊区境内，经乐山镇的于磨房屯后入新立城水库。出库后流经永春乡的龙王庙、莲花泡和新立城镇的袁家窝堡、南岗子、红咀子入市区后，经东大甸子涝区二排干（长春市第一机砖厂北800米）处，又流入郊区境内，再经兴隆山镇的西苟家屯、三家子屯，大房子屯和兰家乡的尹家屯，在马哨口屯出境，在德惠县靠山屯入饮马河。全长342.5公里，流域面积8440平方公里。郊区境内段50.26公里，流域面积711.16平方公里。伊通河流域平均年降水量为4.215亿立方米，年平均径流量为5456.49万立方米。新立城水库以上为上游，两岸为丘陵，河谷宽1～2公里，河道弯曲，河槽宽而浅，河底多为泥砂夹砾石。新立城水库以下郊区境内为中游，两岸为台地，半平原地带，河谷宽5～10公里，河道弯曲，河槽窄浅，一般呈“V”形。丰水年水面宽70～300米，水深4.5～5.5米，流速0.9～1.3米每秒。平水年水面宽25～50米，水深2～2.5米，流速0.8米每秒。枯水年水面宽1～30米，水深0.5米，流速0.3米每秒。

伊通河干流上有大型水库一座——新立城水库，有百千瓦抽水站5处，小型抽水站14处。境内主要支流有新凯河、伊丹河、小河沿子河。

新凯河 新凯河发源于伊通县景台乡大黑山庙岭。系自然河道，河道窄浅多弯，经怀德县的范家屯流入郊区合心乡的王家楼屯、石虎屯，在姜家店屯出境。在农安县代平房屯入伊通河。全长113.7公里，流域面积2289平方公里，郊区境内河长18公里，流域面积207.75平方公里。新凯河流域平均年降水量为1.195亿立方米，年平均径流量为952.66万立方米。郊区段内河槽窄浅，呈“U”形，水势平稳。水量随季节变化，除大洪水跑滩外，一般均不超过100米，枯水期窄到2米。特大洪水时水深可达7米，常见洪水2～4米，枯水期在1米以下，有时发生河干。特大洪水时流速不超2米每秒，常见洪水1.3米每秒，平水时在1米每秒以下。河水因受范家屯糖厂和长春第一汽车制造厂排放废水污染，总污染指数为6.87，为重度污染，不能饮用。

伊丹河 伊丹河发源于伊通县二道乡流沙村夹槽屯东南。流径伊通县的二道乡、伊丹乡，在郊区乐山镇的前瓮圈屯入境，流经腰瓮圈屯、双榆树屯、徐家屯，在霍家店屯分两支：一支为老河道，流经霍家店屯，在于家磨坊屯北一公里处入伊通河。另一支是引伊丹河水种水田，挖的引渠变为伊丹河主河道。流经郊区大南乡的窨子屯、刘家屯、何家窝堡屯，在腰孤榆树屯入新立城水库。全长58.5公里，流域面积483平方公里，郊区境内河长15公里，流域面积29.8平方公里。

小河沿子河 小河沿子河发源于郊区农林乡的孔家屯。流经农林乡的安家沟屯、朱大屯、董家店屯后入净月水库，出库后流经南关区净月乡的逯家湾屯、小河台屯、东小河沿子屯后，在南郊电灌站—号闸入伊通河。全长24.8公里，流域面积98.6平方公里。郊区境内河长16.5公里，流域面积79平方公里。

雾开河 雾开河发源于双阳县泉眼沟乡的后砬子屯东，流经三道镇的大顶子屯、和平村、四合村，在兰家岗子屯出境，后流入九台县的五一水库。全长132公里，流域面积1198平方公里。郊区境内河长21.5公里，流域面积95.02公里。平均年降水量为0.58亿立方米，年平均径流量为765.98万立方米。河道弯曲、河岸较陡，河槽较窄，在30米以内，一般呈“V”形。河水季节性变化大，盛夏降雨集中，河槽窄浅，河水一时宣泄不下，常漫溢出槽成灾，在枯夏少雨季节，河槽水量极小。