自元代开元寺万安法师开山立开元宗一脉。在元代共传19代：

开山祖师 万安菩萨

第二代 通慧崇润禅师

第三代 梅庵崇郎禅师

第四代 明空崇悟禅师

第五代 百泉崇禹禅师

第六代 龙溪崇俨禅师

第七代 草堂广诠禅师

第八代 清泉崇音禅师

第九代 银山妙用禅师

第十代 柏山妙生禅师

第十一代 静岩妙安禅师

第十二代 损庵洪益禅师

第十三代 翠峰普琳禅师

第十四代 寿峰普俊禅师

第十五代 无极洪缘禅师

第十六代 高峰普镇禅师

第十七代 藏峰胜悦禅师

第十八代 月照洪迈禅师

第十九代 月溪禧顺诸禅师

根据《禅门日诵》记载，万安禅师为洞山下二十八世（雪庭下十四世）传人，万安禅师演三十二字传灯，俗呼为贾菩萨宗。这三十二字为：

广从妙普 洪胜禧昌 继祖续宗 慧镇维方

圆明净智 德行福祥 澄清觉海 了悟真常

在对开元寺进行调查时，发现了与这三十二字法嗣相关的碑文资料，现例举一二。

1．至元十六年三月（1279）《百泉禹禅师之塔》。禹禅师为第二代“从”字辈法嗣，全称为百泉从禹。百泉禹禅师塔由提点僧峰尘题额，上有“妙”字法嗣多人，如妙宜，妙信，妙俭，妙全，妙证等。邢台塔林。

2．至元二十五年十月（1288）《通理大师提点隐公塔》有第三代“妙”字辈法嗣妙旭、妙增。邢台塔林。

3．大德元年七月（1297）《正信弘发大师从正寿公之塔》正信弘发大师也为第二代“从”字辈法嗣，在这块碑还有第四代“普”字辈法嗣二十五人，如普兴，普云，普定，普进，普庆，普住等；第五代“洪”字辈法嗣六人，如洪满，洪奕，洪武，洪彦等。邢台开元寺。

4．大德三年八月（1299）《普化大师（王羽）公之塔》。邢台塔林。

5．至元十八年九月（1281）《圆融大师通悟大师》，碑文记载“顺德广平二路僧断妙泽等立石，”其后列有长老妙殿、妙窝容，妙颜，讲主妙行，妙兴……法孙尚座普义，普雄，普顺，普喜，普法，普汝，普瑞等十九人。

6．至元二十二年重九日（1285）普美等人立《讲主之塔》，碑文记载：“顺德广平等路大开元寺一宗前僧录兼本寺官门执事妙昱书丹”，上有“妙”字辈法嗣三人，“普”字辈法嗣五人。

此外在开元寺塔林有喜公庄王之塔，为第七代“喜”字辈法嗣。

后来万安的第三世弟子兴阳清剖妙净禅师演派二十八字。

妙明觉海圆宏广 悟本真常慧性宽

祖道兴隆传法眼 普周沙界定心安

这个传承偈到解放初期已经用到了第二十八代“常”字辈法嗣。在七十年代时，开元寺小和尚常和尚还健在。万安法嗣（贾菩萨宗）后传入九华山，现在从贾菩萨派下常字起续演二十八字。

常持妙法胜庄严 果证无为道上玄

西来大意修般若 月朗天中振万年

在万安禅师后，元代邢州大开元寺传人中出现了两位高僧大德，而且都是曾受国师戒并加封吉祥号的高僧，一位是庆吉祥，一位是益吉祥。

庆吉祥博学多才，精通经学，受命编纂《至元法宝勘同总录》一书。《至元法宝勘同总录》是一部记录元代汉藏《大藏经》译经目录的著作。

益吉祥全称为损庵洪益，损庵洪益（1263-1340）为万安禅师的“洪”字法嗣第五代传人。

损庵洪益在辞动大开元寺住持后，于1340年力请到少林寺担任住持，当年圆寂。少林寺于1341年在少林寺塔林为损庵立《特授中奉大夫大开元都宗摄少林禅寺住持损庵和尚之塔》。

元代，开元寺海闻和尚，也是一位得道高僧。1246年山东东昌12岁的镏氏子拜海闻和尚为师，名志德，号云岩。出师后在金陵天禧寺任住持。

万安禅师不仅为曹洞宗的传人，还兼修净土宗，元翰林修撰《顺德府大开元寺普门塔记铭》说万安师在临清清泉将净土寺曾“……建净土道场，师为作白莲花会，规模一以庐山远公为式”。著有《白莲集》。万安弟子众多，还开示临济法门，《禅门日诵》记载关于临济宗传灯时，说续有：

真隶顺德府东开元寺万安禅师演派四十字：

庆淇通大觉 心印续咸宗

正知为妙义 普周法界同

慈宽能真远 行广自国从

本性佛光照 万法字皈明

明代见于记载的开元寺传人不是很多，历史资料有待于今后发掘。但从开元寺寺史上看，开元寺地位急剧下降有两个原因，一是元末初战争对开元寺的损坏，第二就是明代刘健势力对开元寺的故意压制。

刘健（1433-1526），弘治时人，字希贤，洛阳人。明天顺四年（1460）进士，成化中参与修《英宗实录》，至孝宗即位，进礼部右侍郎兼翰林学士，累进尚书、太子太保、太傅、大学士，并较长时期担任内阁首辅，深得孝宗信赖，有《刘文靖公奏议》等书传世。刘健之大父就是刘绍祖（一为刘起祖），在元末红巾军攻打邢州时，为了抢占寺产以供军需，给开元寺戴上“僧多不义”的帽子，“并悉戳之，焚其浮图”。万历本《顺德府志》记载，在天顺七年，洛阳邢伯玉为邢台知县，当时顺德府城内“老释宫居什九，皆极土木之丽”“而宣圣庙学宫模规狭隘”。于是“非古迹百余区悉撤之，逐取其材合所市者，聚工以新学”。这件事受到了同乡刘健的赞赏，并为此写就了《邢台县儒学记》碑文。

开元寺在明洪武年，在顺德府开元有僧纲司，都纲、副都纲都是由“继”字辈法嗣担任；明嘉靖《顺德府志》说：开元寺“洪武间僧纲司寓焉，都纲继口，副都纲继腾重修。”正德三年（1508）已传至“祖”字辈，有首座祖奎，住持祖奎英。特别值得一说的是，在开元寺的历史上，有两位高僧出任了少林寺住持，一个是元代的损庵洪益大师，另一个就是明代的小山宗书和尚。

小山宗书，为曹洞宗第二十四代传人，开元寺“宗”字法嗣第十代传人，字大章，别号小山，顺德南和县（河北省南和县）人。生于明弘治十三年，明武宗正德四年，这一年小山十岁，便入学堂启蒙。悟“儒书皆教人人世之法，而非出世法也”，因而笃志出家。明正德九年，父母将小山宗书送入顺德府开元寺拜钿和尚为师。两年后，在太行山越三载寒暑，手抄《华严经》。此后游学入少林从虚白老和尚学习。嘉靖九年，小山宗书回到顺德府开元寺省侍本师钿和尚。少林寺多次请小山宗书为住持，都力辞没有到任。嘉靖三十六，在当地官员与少林长老的要求下，小山才就任少林住持。于1567年圆寂。

民国时邢台开元寺传人见于记载的为议果禅师，民国三十二年时，由住持议果发愿对邢台开元寺进行了一次大修，并在观音殿前立《重修顺德开元寺碑记》石幢。